Чтобы показать всплывающее окно на javascript, которое индексируется поисковыми роботами, можно использовать следующий html:
<a href=mypage.htm onClick=window.open(this.href,'windowname','width=600,height=600'); return false;>click me</a>
Теперь, роботы смогут индексировать страницу, но пользователи с включенным javascript будут видеть всплывающее окно.
Нажмите "click me" с включенным и выключенным javasript в браузере для проверки:
click me
.gif){kind=small}
.gif){kind=small}
.gif){kind=small}
.gif){kind=small}